জগন্নাথ বিশ্ববিদ্যালয় বা সংক্ষেপে জবি (JNU) এর সাথে জড়িয়ে আছে ১৬৪ বছরের ইতিহাস। ২০০৫ সালে বিশ্ববিদ্যালয় হিসেবে যাত্রা শুরু করলেও জবির পথ চলা শুরু হয় আরও অনেক আগে। ১৮৫৮ সালে প্রতিষ্ঠিত ব্রাহ্ম স্কুলের পরিবর্তিত নামই আজকের জগন্নাথ বিশ্ববিদ্যালয়। ১৮৭২ সালে বালিয়াটির জমিদার কিশোরী লাল রায় তাঁর পিতা জগন্নাথ রায় চৌধুরীর নামে এ বিদ্যাপীঠের নামকরণ করেন। ২০০৫ সালের ১১ সেপ্টেম্বর ৮ম জাতীয় সংসদের ১৮তম অধিবেশনে ‘জগন্নাথ বিশ্ববিদ্যালয় আইন-২০০৫’ সংসদে উত্থাপিত হয়। ওই বছরেরই ২০ অক্টোবর সরকার প্রজ্ঞাপন জারি করে জগন্নাথ কলেজকে একটি পূর্ণাঙ্গ বিশ্ববিদ্যালয় হিসেবে ঘোষণা করে। বর্তমানে জবির শিক্ষার্থী সংখ্যা ২০ হাজারের-ও বেশী।
প্রতিষ্ঠাকালে জবির ৪টি অনুষদ, ২২ টি বিভাগে প্রায় ২৬ হাজার শিক্ষার্থী নিয়ে যাত্রা শুরু করে। বর্তমানে বিশ্ববিদ্যালয়টিতে রয়েছে মোট ৭টি অনুষদ, ৩৮টি বিভাগ, ২টি ইন্সটিটিউট। জগন্নাথ বিশ্ববিদ্যালয়ের অনুষদ ও বিভাগসমূহ-
| অনুষদ | বিভাগ |
| প্রাণ ও ধরিত্রী বিজ্ঞান অনুষদ | ফার্মেসী বিভাগ |
| অণুজীববিজ্ঞান বিভাগ | |
| প্রাণরসায়ন ও অনুপ্রাণ বিজ্ঞান বিভাগ | |
| জিনতত্ত্ব প্রকৌশল ও জৈবপ্রযুক্তি বিভাগ | |
| প্রাণিবিদ্যা বিভাগ | |
| উদ্ভিদবিজ্ঞান বিভাগ | |
| মনোবিজ্ঞান বিভাগ | |
| ভূগোল ও পরিবেশ বিভাগ | |
| বিজ্ঞান অনুষদ | কম্পিউটার বিজ্ঞান ও প্রকৌশল বিভাগ |
| গণিত বিভাগ | |
| পদার্থ বিজ্ঞান বিভাগ | |
| রসায়ন বিভাগ | |
| পরিসংখ্যান বিভাগ | |
| ব্যবসায় শিক্ষা অনুষদ | হিসাববিজ্ঞান ও তথ্য ব্যবস্থাপনা বিভাগ |
| অর্থসংস্থান বিভাগ | |
| মার্কেটিং বিভাগ | |
| ব্যবস্থাপনা শিক্ষা বিভাগ | |
| সামাজিক বিজ্ঞান অনুষদ | গণযোগাযোগ ও সাংবাদিকতা বিভাগ |
| অর্থনীতি বিভাগ | |
| চলচ্চিত্র ও টেলিভিশন বিভাগ | |
| নৃবিজ্ঞান বিভাগ | |
| সমাজ বিজ্ঞান বিভাগ | |
| সমাজকর্ম বিভাগ | |
| লোক প্রশাসন বিভাগ | |
| রাষ্ট্রবিজ্ঞান বিভাগ | |
| কলা অনুষদ | বাংলা বিভাগ |
| ইংরেজি বিভাগ | |
| দর্শন বিভাগ | |
| ইতিহাস বিভাগ | |
| ইসলামি শিক্ষা বিভাগ | |
| ইসলামের ইতিহাস ও সংস্কৃতি বিভাগ | |
| নাট্যকলা বিভাগ | |
| সংগীত বিভাগ | |
| চারুকলা অনুষদ | ড্রইং অ্যান্ড পেইন্টিং |
| প্রিন্টমেকিং | |
| ভাস্কর্য | |
| আইন অনুষদ | আইন বিভাগ |
| ভূমি ব্যবস্থাপনা ও আইন বিভাগ | |
| ইন্সটিটিউট | আধুনিক ভাষা শিক্ষা ইন্সটিটিউট (IML) |
| শিক্ষা ও গবেষণা ইন্সটিটিউট (IER) |